车辆工程（汽车）与车辆工程（轨道交通）有什么区别

是完全不同的两个学院。汽车是汽车学院的，而轨道交通是铁道与城市轨道交通专研究院的，其前身是铁道大属学，后来并入同济。
本科的话，第一第二年的基础课内容是完全一样的。到第三年开始分专业而选择不同课程。