上海地铁十二线只限公交卡什么意思

应该是换乘仅限公交卡。即在南京西路站换乘12号线时，需要出站换乘（出站后再次刷卡进站）。持公交卡的乘客，如出、进站两次刷卡间隔30分钟以内，享受连续计费；单程票的乘客需重新购票乘车。